
安捷倫生物分析儀實(shí)現(xiàn)核酸蛋白樣品質(zhì)量精準(zhǔn)控制
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本文詳細(xì)探討安捷倫4200 TapeStation系統(tǒng)在生物樣品質(zhì)量控制中的技術(shù)優(yōu)勢(shì)。系統(tǒng)分析其電泳分離原理、微流體芯片設(shè)計(jì)和智能化數(shù)據(jù)分析算法,闡述其在基因組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究中對(duì)DNA、RNA樣品質(zhì)量評(píng)估的重要價(jià)值。
正文:
下一代測(cè)序技術(shù)的快速發(fā)展對(duì)樣品質(zhì)量提出了更高要求。安捷倫4200 TapeStation系統(tǒng)通過(guò)自動(dòng)化電泳分析,為核酸和蛋白樣品質(zhì)量提供了快速、準(zhǔn)確、可重復(fù)的評(píng)估方案。
該系統(tǒng)采用 微流體芯片技術(shù),每個(gè)芯片包含16個(gè)獨(dú)立樣品孔道,孔徑精確控制在50μm,確保分離重現(xiàn)性。電泳分離在約55℃條件下進(jìn)行,使用取代型熒光染料,靈敏度達(dá)0.5 ng/μL,動(dòng)態(tài)范圍跨越3個(gè)數(shù)量級(jí)(5-5000 pg/μL)。
在DNA分析方面,系統(tǒng)提供基因組DNA ScreenTape檢測(cè)方案,可準(zhǔn)確評(píng)估DNA完整性(DIN值),區(qū)分降解和完整DNA。研究表明,DIN值>7的樣品在WGS測(cè)序中可獲得>95%的mapping rate,而DIN值<8的樣品n50值下降50%。在rna分析中,rna完整性數(shù)值(rin)與測(cè)序數(shù)據(jù)質(zhì)量高度相關(guān),rin值>8的樣品在RNA-Seq中可檢測(cè)到多20%的低表達(dá)基因。
智能化數(shù)據(jù)分析是另一大亮點(diǎn)。系統(tǒng)自動(dòng)計(jì)算濃度、完整性指標(biāo),并提供凝膠狀圖像和電泳圖譜。算法采用機(jī)器學(xué)習(xí)技術(shù),可識(shí)別常見(jiàn)降解模式(如5'端降解、隨機(jī)降解等),給出樣品質(zhì)量預(yù)警。檢測(cè)時(shí)間僅需1-2分鐘/樣品,比傳統(tǒng)瓊脂糖電泳效率提高10倍。
應(yīng)用數(shù)據(jù)顯示,在大型基因組計(jì)劃中,該系統(tǒng)成功對(duì)超過(guò)10萬(wàn)個(gè)樣品進(jìn)行質(zhì)量篩選,淘汰率15%,顯著提高了測(cè)序數(shù)據(jù)質(zhì)量。在單細(xì)胞測(cè)序中,可準(zhǔn)確評(píng)估微量樣品(100 pg)質(zhì)量,為單細(xì)胞研究提供了可靠的質(zhì)量控制方案。
關(guān)鍵詞: 生物分析儀、樣品質(zhì)量控制、DNA完整性、RNA完整性、下一代測(cè)序
