短期儲存：若在 1 - 2 個月內使用，可將變性蛋白上樣緩沖液置于 4℃環境儲存。此溫度下，緩沖液中成分的化學活性相對降低，能一定程度減緩成分降解，維持緩沖液性能穩定，且方便隨時取用。

長期儲存：若需長期保存，應將緩沖液分裝后凍存于 - 20℃。分裝能避免反復凍融對緩沖液造成損害，因為每次凍融都可能導致溶液中成分的物理化學性質改變，如蛋白質聚集、試劑沉淀等。例如，含 β - 巰基乙醇的緩沖液，反復凍融可能加速其氧化，降低對蛋白質二硫鍵的還原能力。

密封容器：儲存緩沖液的容器必須密封良好，防止水分蒸發、外界空氣進入。空氣中的氧氣會加速緩沖液中還原性成分氧化，水分蒸發則會改變緩沖液濃度，影響其性能。

無菌操作：取用緩沖液時，要保證使用的器具無菌且干凈，避免引入微生物、雜質。微生物在緩沖液中生長繁殖，可能消耗成分或產生代謝產物，污染緩沖液，干擾后續電泳實驗。